La fauna patagónica no es muy diversa, pero hay animales que prácticamente sólo se pueden ver aquí, como el pingüino magallánico y el ñandú. No existen especies endémicas en la Patagonia, es decir, todos los animales que se pueden ver también existen en otras partes del continente. Y a pesar de ello la cantidad de aves que hay en la Patagonia es exorbitante. Típicos de esta región son el puma, el ñandú, el zorrillo, el guanaco, y probablemente la única especie endémica de la Patagonia: El zorro culpeo (Lycalopex culpaeus magellanicus). También otros animales como las ballenas y los lobos marinos forman parte de la fauna patagónica.
