Wie alle Schlanklibellen der Gattung Azurjungfer (Coenagrion) hat die Hufeisenjungfer einen schwarz-blauen Körper. Das einfachste Unterscheidungsmerkmal ist eine Zeichnung auf der oberen Seite des 2. Segmentes. Diese Zeichnung soll an eine Fledermaus erinnern, dafür aber, braucht man eine gut entwickelte Vorstellungskraft. Verwechslungsmöglichkeiten gibt es mit der Gemeinen Becherjungfer und mit der Hufeisen-Azurjungfer.